对于脐腐病的发生，国内研究大都认为是缺钙引起的。

发病初期在幼果和青果脐部形成水渍状绿色斑点，随着果实的生长，斑点逐渐变成暗褐色，并扩大发展到果实顶部至大半个果面，病部形成革质、褐色或黑色坏死区域，果肉组织腐烂，失水收缩，顶部凹陷。

在潮湿条件下，病部形成黑色或红色霉状物，严重时果底腐烂或产生斑点。坚硬的褐色区域可以扩展至果实内部，病果提早变红，属于典型的生理病害。

钙在细胞中起着关键的作用，植株通过水吸收钙，但是钙移动性较差，如果番茄生长过快，或者其他因素影响水分的吸收，就会导致钙的吸收和转运受影响，所以不管土壤中是否有足够的钙，但植物不能吸收足够的钙，植株的组织会分解，并在脐部留下明显的损伤，出现脐腐病症状。

土壤水分供应失调或不稳定，尤其是在结果期土壤干旱、供水不足时如浇水不及时，土壤水分变动剧烈，幼果和青果脐部大量失水而引起组织坏死。

施氮肥过多，刺激植株营养生长，消耗了供应果实生长的钙元素，会造成果脐周围细胞生理紊乱；连年种植，土壤中所需营养相对减少，土壤中钙素不足，尤其是植株吸收的钙离子低于临界值会引发脐腐病。

较低的地温，影响根系发育， 影响植株对水分和钙的吸收， 从而引发脐腐病。

根系受损是生产中经常遇到的问题，当浇水过大或施肥过多，就会引起沤根或烧根问题，进而影响水分和养分的吸收，导致脐腐病等各种问题的发生。

不合理的施肥，尤其是化肥的大量使用，会造成土壤酸碱度过高或过低 ，这就会导致植株生长受阻，发育迟缓，营养吸收受影响，此外，酸碱不平衡也会阻碍钙元素的吸收。

脐腐病的防治总体上比较困难，根据该病发生特点，宜在优化栽培管理的基础上进行预防为主，综合防控。

采用地膜覆盖栽培的，保持土壤水分相对稳定，可减少土壤中钙质流失。开花结果期如遇高温干旱应及时浇水，雨季注意排水，确保根系正常生长。

除施足腐熟有机肥作底肥以增强土壤蓄水能力外，应增施钙质肥料，控制氮肥用量，避免使用含氮量过多的肥料，提高植株耐病能力，还可施用一定量的过磷酸钙，防止土壤缺钙。

番茄种子需要至少15.6℃的土壤温度才能发芽。移栽是要保证土壤地温在13℃以上，对预防番茄脐腐病有较好的效果。

幼果期及时摘除腐烂果实，未发病嫩果及时喷施硼、钙肥预防，以减少植株体内的养分消耗和避免交叉传染，保证果实健康生长。

土壤的酸碱度在6.2到6.8之间对番茄最好，可以用生石灰来进行调节，同时可以使用土壤调理剂来调理土壤，给根系营造适宜植株生长的环境条件。